Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED1Q15648 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED1Q15648 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED1Q15648 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED1Q15648 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED1Q15648 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED1Q15648 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED1Q15648 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED1Q15648 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED1Q15648 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms