Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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