Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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