Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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