Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NBR1Q14596 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NBR1Q14596 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms