Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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