Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms