Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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