Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms