Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms