Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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