Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELP6Q0PNE2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELP6Q0PNE2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms