Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RBBP4Q09028 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms