Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms