Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHDQ02161 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms