Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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