Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms