Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms