Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JAG1P78504 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms