Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB15P59190 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB15P59190 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB15P59190 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB15P59190 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms