Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAPAP54920 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NAPAP54920 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms