Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms