Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms