Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PIK3CBP42338 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms