Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms