Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms