Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELFEP18615 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELFEP18615 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELFEP18615 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELFEP18615 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELFEP18615 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NELFEP18615 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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