Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DESP17661 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DESP17661 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DESP17661 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DESP17661 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms