Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB1P16220 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms