Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN1P12814 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms