Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TMEM225BP0DP42 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TMEM225BP0DP42 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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