Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM10L1P0DMW3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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