Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCAP01258 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCAP01258 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCAP01258 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms