Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HOXA3O43365 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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