Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCAMP3O14828 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms