Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F3O00716 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F3O00716 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms