Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF25A6NGN4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF25A6NGN4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF25A6NGN4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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