Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS37CA5D8V6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms