Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIPSLA2A3N6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms