Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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