Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms