Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms