Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms