Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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