Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTLNQ9NXG0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTLNQ9NXG0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms