Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms