Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-5Q9HDB9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms