Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC13A1Q9BZW2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC13A1Q9BZW2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms