Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms