Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDRT15Q96T59 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms